En este episodio comenzamos a hablar de unos organismos muy especiales, los mohos mucilaginosos. Comenzamos por los mohos mucilaginosos plasmodiales, a los que llamamos "amebas sabias" por muy buenas razones.

Aquí una foto de un moho mucilaginoso plasmodial muy chulo: embark-breakthoughs-slime-mold-learning.jpg (1280×1280)

Aquí un vídeo de un moho mucilaginoso plasmodial moviéndose:

https://youtu.be/sgNAZAB6OTk

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Podcast de divulgación científica en español. El objetivo es enseñar conceptos de biología en lenguaje sencillo para público no especializado y de forma breve (10-20 minutos). Empezaremos por lo básico pero iremos pasando a cosas más complejas y de actualidad con el tiempo. Este programa se realiza con el apoyo de la Fundación Laboratorio de Anatomía Animal, visítanos en http://anatolab.net/. El logo es un trabajo de NiModo Creations (https://www.nimodocreations.com/). Muchas gracias a Those Who Ride with Giants por permitirme usar partes de su tema: The Scent of the Old Ocean como intro y outro (https://thosewhoridewithgiants.bandca...)

En este episodio hablamos de la transferencia horizontal de genes, una serie de mecanismos que permiten a procariotas (bacterias y arqueas) desafiar nuestra idea intuitiva de cómo funcionan los genes, e incluso nuestro concepto establecido de la evolución de los seres vivos.

Aquí un esquema de un bacteriófago:

Archivo:Tevenphage-es.svg - Wikipedia, la enciclopedia libre

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En el episodio de hoy hablamos de distintas hipótesis sobre los tipos de compatibilidad en la reproducción sexual de Eukarya, y de la aparición de la anisogamia con dos sexos en muchos grupos de células con núcleo. 

Os dejo un artículo muy bueno al respecto para los que queráis ahondar en el asunto. 

https://citeseerx.ist.psu.edu/document?repid=rep1&type=pdf&doi=a87ef95292f3fd9569c9abfcdde1356ef3638659

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En el episodio de hoy toca hablar un poco de los zorros en general, y de ciertos zorros rusos particulares que nos pueden ayudar a resolver un curioso enigma que continúa sin resolver desde los tiempos de Charles Darwin. 

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Prueba con Remdesivir

https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)31022-9/fulltext

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Hoy damos un repaso a los orígenes de la fotosíntesis entre las células con núcleo, mencionamos algunos de los principales tipos de algas (con muchos más que se nos quedan en el tintero, sobre todo unicelulares) y mencionamos a un organismo muy especial que tiene encantados a los estudiosos de la endosimbiosis. 

Aquí un ejemplo del tipo de estructuras donde ocurre la fotosíntesis en cianobacterias y cloroplastos: 

https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/2/2b/Chloroplast_in_leaf_of_Anemone_sp_TEM_85000x.png

Una foto de Paulinella chromatophora con sus cianobacterias

https://schaechter.asmblog.org/.a/6a00d8341c5e1453ef016767992d89970b-320wi

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Hoy toca meterse en cosas un poco complejas para hablar de los principios en los que se basa la fotosíntesis, un proceso bioquímico muy importante para la vida en la Tierra. 

Es necesario tener en cuenta que esta es una visión muy por encima, pero espero que pueda servir como una forma de asimilar los fundamentos del tema. 

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 Diseño de drogas por ordenador. 

https://science.sciencemag.org/content/early/2020/04/21/science.abb4489

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Anticuerpos monoclonales
https://www.nature.com/articles/s41467-020-16256-y

Proteína fusión ACE2
https://www.nature.com/articles/s41467-020-16048-4

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En el episodio de hoy acabamos la serie sobre los cefalópodos hablando del nautilo, un animal bastante diferente a sus primos. Además de ser muy interesante, el nautilo nos da una excusa para hablar de un tema contencioso en biología evolutiva, el concepto de "fósil viviente".

Enlazo a una foto de una concha de nautilo, nótese el pequeño hueco en los tabiques de las cámaras por donde pasa el tubo vascularizado del animal:

https://i.pinimg.com/564x/fc/eb/bf/fcebbfe70a3fa76c64942267224b74ea.jpg

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Hoy toca hablar un poco en general de los cefalópodos, y nos centraremos en las sepias para explicar los mecanismos del cambio de color de la piel, y cómo los usan para camuflaje, caza y reproducción.

Una imagen de los cefalópodos. Arriba a la izquierda: pulpo. Arriba a la derecha: calamar. Abajo a la izquierda: sepia. Abajo a la derecha, nautilo.

https://commondescentpodcast.files.wordpress.com/2017/08/sj4wdb9lukn00ouup0ejoxq.png

y la fuente por si interesa: https://commondescentpodcast.wordpress.com/2017/08/27/episode-16-cephalopods/

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Hoy comento un poco una publicación interesante que leí sobre la creación de anticuerpos de llama contra el SARS-Cov-2:

https://www.cell.com/pb-assets/products/coronavirus/CELL_CELL-D-20-00891.pdf

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Esta semana toca hablar del pulpo, un animal que llama la atención de científicos de muchos campos distintos debido a una inteligencia poco común fuera de los animales vertebrados.

En esta imagen en la última fila (C) se puede ver a un pulpo que se camufla de forma muy rápida y efectiva:

https://oxfordre.com/doc/10.1093/acrefore/9780190264086.001.0001/acrefore-9780190264086-e-182-graphic-003-full.jpg

La publicación completa para quien tenga interés:

https://oxfordre.com/neuroscience/view/10.1093/acrefore/9780190264086.001.0001/acrefore-9780190264086-e-182

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En el episodio de hoy, seguimos divagando sobre cómo el ser humano se las apaña para navegar dos mundos extraordinariamente complicados sin volverse completamente) loco. Y de cómo el lenguaje y las comunidades son importantes para esto.

Aquí la serie de clases de Sapolsky, merecen mucho la pena:

1. Introduction to Human Behavioral Biology - YouTube

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 Angiotensina e inflamación

https://marlin-prod.literatumonline.com/pb-assets/products/coronavirus/immuni4349_S5.pdf

Droga prometedora

https://www.nature.com/articles/s41586-020-2223-y_reference.pdf

Dudoso

https://chemrxiv.org/articl es/COVID-19_Disease_ORF8_and_Surface_Glycoprotein_Inhibit_Heme_Metabolism_by_Binding_to_Porphyrin/11938173

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Biólogo con el cerebro roto por la cuarentena habla sobre el tratamiento prudente de los datos. No tomar muy en serio. 

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Un poco de charla sobre las últimas publicaciones que he estado leyendo sobre el coronavirus.

Virus y eje renina angiotensina: https://jamanetwork.com/journals/jamacardiology/fullarticle/2764299

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1002/ddr.21656?casa_token=SmDMsCxXMXIAAAAA:UdC87CvGWfNWwBFroBcOtimm_IqncNkAXJF_8UMvFYbYX7CeIVwS9UC9MUXfC8kuNLHa7mqRBT6n5ac

https://link.springer.com/article/10.1007/s00134-020-05985-9

https://www.cell.com/pb-assets/products/coronavirus/CELL_CELL-D-20-00739.pdf

Reguladores del sistema inmune, controversia: 

https://www.thelancet.com/journals/laninf/article/PIIS1473-3099(20)30262-0/fulltext

https://www.thelancet.com/journals/laninf/article/PIIS1473-3099(20)30270-X/fulltext

Hurones

https://www.cell.com/cell-host-microbe/fulltext/S1931-3128(20)30187-6

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En el episodio de hoy hablo un poco de los coronavirus, una familia de virus que en los últimos años han saltado tres veces a los humanos, uno de los cuales es el causante de COVID-19, la pandemia que nos tiene a todos encerrados últimamente. 

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En este episodio vamos a hablar un poco del origen de las mitocondrias, la principal fuente de energía de nuestras células, y de lo que su origen nos dice sobre la evolución de las células con núcleo en general. 

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Hoy veremos la reacción química principal que nos permite a las células con núcleo sacar energía de nuestro medio ambiente y de la estructura que nos permite hacerlo: la mitocondria.

Aquí hay una imagen de microscopía electrónica de una bacteria:

https://media.eurekalert.org/multimedia_prod/pub/web/153435_web.jpg

Aquí una imagen de microscopía electrónica de una ameba.La imagen B(i) es la que nos interesa. En la barrita de abajo a la derecha de la ameba caben unas 20 bacterias en fila. 

https://media.springernature.com/full/springer-static/image/art%3A10.1038%2Fsrep13381/MediaObjects/41598_2015_Article_BFsrep13381_Fig1_HTML.jpg

La fuente de la imagen de la ameba es este artículo, por si a alguien le interesa leer algo más: 

https://www.nature.com/articles/srep13381

Finalmente, una animación aproximando la forma y funcionamiento de la ATP sintetasa:

https://thumbs.gfycat.com/CornyDownrightHamster-small.gif

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En este episodio hablamos un poco de las características que definen a las células con núcleo y que explican en parte su enorme tamaño y complejidad cuando se comparan con las bacterias. 

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En este episodio intentamos hacernos una idea de cómo de pequeña es una célula animal, una bacteria o una proteína, y hacemos énfasis que dentro del mundo de lo diminuto nuestras células son cosas increíblemente grandes y complejas. 

Aquí una foto de una escultura de cuerdas, que es como me suelo imaginar yo una proteína en su forma doblada, lista para cumplir su función. 

https://tinyurl.com/qr9tldy

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Hoy hablamos un poco de un animal muy llamativo pero del que sabemos menos de lo que pensamos: la jirafa. También tomamos un par de desvíos para hablar del concepto de especie y de la selección sexual. 

Foto de una jirafa: 

https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/9e/Giraffe_Mikumi_National_Park.jpg/800px-Giraffe_Mikumi_National_Park.jpg

Foto de un okapi, primo de la jirafa: 

https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/1/18/Okapi2.jpg

Distribución de las jirafas: 

https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/4/4a/Giraffa_camelopardalis_distribution2.png

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En este episodio de divagaciones charlo un poco sobre el espectro de optimismo-pesimismo con el que la ciencia ficción trata la relación de tecnología y sociedad, y hablo un poco de mi opinión con respecto a dónde en este espectro podría encajar la edición genética con CRISPR/Cas y tecnologías similares. No tomar demasiado en serio. 

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Hoy hacemos un episodio juntando un par de temas variados.

El primero es sobre "splicing" o corte y empalme (o montaje, que me gusta más) alternativo de ARN mensajero.

El segundo es sobre Claviceps purpurea, el cornezuelo del centeno, un hongo parásito de gramíneas con una tormentosa relación con la humanidad. 

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En este episodio se habla de la publicación de Crowther y colegas publicada en Nature en enero del 2020, que detalla el descubrimiento de una línea de células T capaces de reconocer muchos tipos de células tumorales y matarlas pero que no atacan a células sanas. 

Enlace al artículo: 

https://www.researchgate.net/profile/Marine_Caillaud/publication/338705584_Genome-wide_CRISPR-Cas9_screening_reveals_ubiquitous_T_cell_cancer_targeting_via_the_monomorphic_MHC_class_I-related_protein_MR1/links/5e281e21a6fdcc70a140ed73/Genome-wide-CRISPR-Cas9-screening-reveals-ubiquitous-T-cell-cancer-targeting-via-the-monomorphic-MHC-class-I-related-protein-MR1.pdf

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En este episodio se habla un poco más en detalle del funcionamiento de CRISPR-Cas, y se explica por qué su uso en biotecnología se considera una innovación muy importante, detallando algunas de sus posibles aplicaciones. 

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El episodio de hoy habla un poco de qué es CRISPR, y de la historia de su descubrimiento, investigación y situación actual. Se aprovecha esta historia para hablar de algunos aspectos generales de la investigación científica. 

Enlace al gen humano HERC2: 

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_000015.10?report=fasta&from=28111040&to=28322179&strand=true

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En este episodio hablamos del otro gran grupo de cetáceos que quedan vivos, los odontocetos, que incluyen entre otras a marsopas, delfines, orcas y cachalotes. Hablamos de la ecolocalización y explicamos por qué los cachalotes son especialmente interesantes.

Aquí una imagen que muestra la variedad de los odontocetos actuales.

https://farm9.static.flickr.com/8530/8541625420_7ab82fa330_b.jpg

Fuente del click del cachalote:

https://dosits.org/galleries/audio-gallery/marine-mammals/toothed-whales/sperm-whale/

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En este episodio hablamos de los misticetos o ballenas de barbas, entre las que se encuentran los animales más grandes del planeta. Hablamos de los distintos grandes subgrupos de estas criaturas y de su comportamiento. 

Como premio para los que se leen las descripciones, dejo un enlace a un vídeo de una ballena papuda comiendo. 

https://www.youtube.com/watch?v=WXkeDSTeT78

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En el episodio de esta semana hablamos de qué son las ballenas y delfines, así como de su historia evolutiva. 

Foto de un delfín: https://es.wikipedia.org/wiki/Tursiops_truncatus#/media/Archivo:Tursiops_truncatus_01-cropped.jpg

Foto de un cachalote: https://ast.wikipedia.org/wiki/Physeter_macrocephalus#/media/Ficheru:Mother_and_baby_sperm_whale.jpg

Foto de una ballena: https://es.wikipedia.org/wiki/Mysticeti#/media/Archivo:Humpback_stellwagen_edit.jpg

Vídeo de orcas varándose para cazar: https://www.youtube.com/watch?v=RKc1ZXGWJVU

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En este episodio le damos café a un biólogo y lo ponemos delante de un micro a ver qué pasa.

Enlaces relevantes:

https://es.wikipedia.org/wiki/H._P._Lovecraft

https://es.wikipedia.org/wiki/Laniakea

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En este episodio ampliamos la visión básica de la función de los genes para incluir la forma en la que se regulan, y cómo conocer esta forma de regularse nos ayuda a ampliar nuestra visión de los mecanismos de la evolución. 

Además, comparamos descaradamente a las personas con cenas de 3 platos y hacemos amistad con un pececito feo y esperanzado. 

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La teoría de la selección natural en su forma clásica no es la única teoría que existió sobre la forma en la que los animales evolucionaban. Y a día de hoy todavía hay biólogos que piensan que no es capaz de explicar bien todos los fenómenos que vemos en la  naturaleza. En este episodio repasamos algunas de las teorías en competición y de las objeciones a la selección natural.

Enlaces a El Gen Egoísta y a El Pulgar del Panda:

https://www.amazon.com/gen-egoista-Selfish-Gene-biologicas/dp/8434501783

https://www.amazon.com/El-Pulgar-del-Panda-Spanish/dp/8484325768

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En este episodio intento dar una idea muy básica qué es el ADN y cómo guarda la información que compone un ser vivo. Esta visión muy básica es la que existió durante los primeros años de la genética molecular, aunque no duró mucho, y como siempre en biología todo se complica en cuanto se mira un poco de cerca. 

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Hoy hablamos de la rata topo desnuda (Heterocephalus glaber), un roedor africano  con una forma de vida muy peculiar para un mamífero y una biología realmente intrigante.

Hoy mencionamos a la familia Bathyergidae de ratas topo africanas.

También mencionamos el episodio 40 - Biología de Tranquis 40 – Altruismo, hormigas, brócolis cuánticos y el valor de tu hermana (buzzsprout.com)

Aquí podéis encontrar algunas fotos de los animalitos de hoy: 

https://imgur.com/a/NFiQNtM

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En este episodio vamos a hablar de la evolución, de cómo los animales cambian a lo largo del tiempo, y de la selección natural, que es la explicación más exitosa que tenemos hasta el momento para entender como funciona. 

Aquí el ensayo de Dobzhansky: https://biologie-lernprogramme.de/daten/programme/js/homologer/daten/lit/Dobzhansky.pdf

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En este episodio hablamos de una teoría sobre el origen de la vida en la que se sugiere que la primera información genética se contenía y transmitía en las irregularidades de pequeños cristales de arcilla microscópicos. Para una publicación científica hablando del tema por el propio autor se puede ir a: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/0022519366901780

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En este episodio se habla un poco de los problemas que existen para determinar cómo comenzó la vida en nuestro planeta, y se delinean las dos principales familias de hipótesis: metabolismo primero y replicador primero. 

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En este episodio se habla un poco más en detalle del concepto de la entropía, y de cómo la vida se puede definir en base a ella. También se plantean un par de cosillas sobre las que filosofar. 

Episodio regrabado a 23/01/2022

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En este primer episodio cubrimos la base más básica de la biología: ¿Qué es la vida y cuáles son sus características fundamentales? ¿Cómo podríamos reconocer la vida incluso si la encontramos en otro planeta y no se parece en nada a nosotros?

Audio actualizado el 31/10/2021

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Hola, soy Nico y este es mi Podcast de biología. La idea es explicar conceptos de biología en lenguaje sencillo de forma relajada y breve, para que la gente no especializada pueda tener un acercamiento a lo que sabemos y lo que no sobre la vida en la Tierra. 

En este primer episodio me presento un poco y hablo del Podcast, su objetivo, formato, qué es y qué no es. 

Es una regrabación, el audio en los primeros episodios es un poco peor, pero va mejorando. 

Si tenéis alguna pregunta, comentario o sugerencia podéis seguir al programa en Facebook o Instagram, o escribir a biologiadetranquis@gmail.com. 

Espero que os guste, ¡Un saludo!

Nico

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¿Cómo distinguimos la realidad de la ficción? El ser humano tiene una capacidad impresionante para la imaginación,  pero eso viene con la desventaja de que podemos perder la noción de qué es real y qué ocurre sólo dentro de nuestras cabezas.

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Hoy hablamos del concepto de historias de vida, que son el conjunto de características que se refieren a cuánto vive un organismo, cómo de grande se hace, cuántas veces se reproduce y cuánto invierte en cada reproducción. Lo conceptualizamos como un juego de estrategia en el que cada organismo debe elegir cómo manejar una cantidad limitada de energía y repartirla entre distintas prioridades. 

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En el episodio de hoy toca hablar un poco más en plan relejado sobre hipótesis sobre el origen de la vida y sobre la vida vista desde el punto de vista de sus requerimientos energéticos. 

Aquí un par de publicaciones sobre el origen de la vida y de las células con núcleo desde la perspectiva de la bioenergética: 

How did LUCA make a living? Chemiosmosis in the origin of life - Lane - 2010 - BioEssays - Wiley Online Library

The energetics of genome complexity | Nature

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En el episodio de hoy continuamos nuestra exploración de la hipótesis de que la vida comenzó en fumarolas alcalinas serpentinizantes parecidas a La Ciudad Perdida. 

Aquí un artículo sobre La Ciudad Perdida: 

Descubre la ciudad perdida en el Atlántico, uno de los entornos más extremos del planeta (rallymundial.net)

Y el artículo sobre la fijación de carbono en reactor: 

Ambient temperature CO2 fixation to pyruvate and subsequently to citramalate over iron and nickel nanoparticles | Nature Communications

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En el episodio de hoy comenzamos a explorar una hipótesis muy interesante sobre dónde y cómo pudo haber surgido la vida. Pero primero necesitamos dar un repaso y presentar a un candidato al metabolismo de las primeras formas de vida. 

La ruta metabólica de la que hablamos se llama la ruta "Wood-Ljungdahl" o "de la acetil coenzima A". 

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Iniciamos la nueva temporada de Biología de Tranquis con un episodio sobre los tunicados, unos animales que son muy interesantes por ser un grupo de cordados que rompen el molde. 

Aquí tenéis algunas fotos como apoyo visual: 

https://imgur.com/a/amEFdRM

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Cerramos la serie sobre la anisogamia y sus consecuencias con un vistazo a los roles sexuales "típicos", a las excepciones que vemos en la naturaleza, y a cómo reconciliamos ambos para crear un marco teórico más completo sobre las adaptaciones y comportamientos de machos y hembras en distintos animales. 

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Cerramos 2022 con unas cuantas divagaciones sobre la utilidad de la ciencia como institución. ¿Para qué sirven todos esos revisores, editoriales índices de impacto y demás parafernalia?  

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